在《太極熊貓》遊戲中提升戰鬥力是非常重要的一件事，除了單刷戰役副本外，組隊副本也是獲得經驗、高級裝備和符文的好方法。透過多人組隊合作的方式，不但可以大幅提升自身實力，還能通過玩家間的團隊合作，增進友誼。
一、進入副本
當玩家等級達到15級時，可以在任意主城透過點擊「歷練」→「組隊副本」轉入組隊副本介面。
二、選擇副本與匹配
遊戲中目前一共設有5個組隊副本，分別是【獸血沸騰】、【亡魂之夜】、【劍之極意】、【絕對零度】、【勾魂索魄】。
選擇要挑戰的副本後，可以進行單人或多人匹配。單人匹配為隨機隊友的組隊模式，多人匹配為固定隊友的組隊模式，可以邀請好友清單中的好友來參與。
三、副本BOSS攻略
雙子猩猩
BOSS為黃猩猩和黑猩猩兩隻怪，他們共用血量。黃猩猩會不斷向牠自己的目標翻滾，擊倒路徑上的玩家和武神。黑猩猩會一系列近戰輸出技能，不但能造成多段嚴重的AOE傷害，也會造成短暫的擊退，擊倒等控制效果。
另外，黑猩猩錘地會觸發黃猩猩空翻技能，這會造成一次極大範圍的AOE傷害。持續數次團隊將崩潰。比較理想的策略是將兩個BOSS拉開，將BOSS破防時可以再會合以增加輸出量。
白骨大帝
團隊模式與劇情模式的白骨大帝玩法上略有不同。玩家在與白骨大帝的戰鬥過程中，場景中央會間隔出現一個不斷漲大的靈魂球，靈魂球存在22秒，期間會由小變大三次，22秒後即會破散並生成出另一個白骨大帝。這個白骨大帝雖然相比主體弱化不少，但還是會給玩家帶來不少麻煩。
玩家在進攻白骨大帝時，需要時刻注意靈魂球的動向，一旦發現靈魂球出現，需要其中一個玩家利用仇恨拖住白骨大帝，另外兩個隊友儘快的擊殺靈魂球，避免新的白骨大帝的出生。
白骨大帝的另外一個能力是攻擊吸取。攻擊過程中，白骨大帝會持續吸取一名玩家的攻擊力，並使得自己的攻擊力不斷增強，最強能達到200%的攻擊力，使得輸出變得極為暴力。但當白骨大帝吸取攻擊力的時候，會有一條連結著白骨大帝和目標玩家的連線，並在目標玩家的頭頂上以感嘆號標誌。此時處於被吸取攻擊力的玩家儘快的與白骨大帝拉開距離，即可把連線拉斷，阻止白骨大帝吸取攻擊。
熊貓劍聖
相比單人模式，組隊模式的熊貓劍聖會週期性的向目標施放一個DEBUFF，中了DEBUFF的玩家或武神會週期性的對周圍友軍造成傷害，但是自身不會受到傷害。需要注意的是，劍聖的幻象也會施放這個技能，組隊模式下，劍聖召喚幻象的最大數量也得到了提升。
因此，這個BOSS需要玩家各自的走位配合（彼此遠離中了DEBUFF的玩家或武神）以及默契的擊殺順序（優先擊中火力擊殺幻象否則場上壓力會過大）。
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